يتكون الهيكل التنظيمي لمركز معاً من الحوكمة والإدارة.
الحوكمة تتكون من ثلاث طبقات:
1. الجمعية العامة
تدير الجمعية العامة التي تضم 67 عضوًا سياسات واستراتيجيات معاً. تحدد الجمعية العامة الأهداف العامة لـ معاً وتضع الأهداف الاستراتيجية. أعضاء الجمعية العامة هم خبراء في مجالات مثل الاقتصاد، والزراعة، والأعمال، والتنمية المجتمعية، وعلوم الكمبيوتر، ودراسات المرأة، والصحة، والمحاسبة، وعلم الاجتماع، والديموغرافيا، والهندسة، وعلم الاجتماع، والتعليم، والقانون الدولي، والتاريخ. يأتي أعضاء الجمعية العامة لـ معاً من مواقع جغرافية وقطاعات متنوعة في فلسطين. كما أن معظم الأعضاء لديهم خبرة واسعة في قطاع المنظمات غير الحكومية.
2. مجلس الإدارة
يتم انتخاب مجلس الإدارة من قبل الجمعية العامة كل عامين، ويتكون من تسعة أعضاء: رئيس المجلس، نائب الرئيس، الأمين، أمين الصندوق، وخمسة أعضاء آخرين. يحضر المدير العام الاجتماعات، ولكن ليس له حق التصويت. يُكلف مجلس الإدارة بتحديد الأهداف القصيرة الأجل والإشراف على عمليات مركز معاً . يلتقي المجلس بشكل شهري ويعمل بشكل وثيق مع المدير العام لتحقيق مهمة معاً.
أعضاء مجلس الإدارة هم:
السيد سامي خضر، المدير العام (وضع غير عضو)
3. اللجان الفرعية لمجلس الإدارة
استنادًا إلى سياسات وإجراءات التوظيف في معاً، فإن الهدف من لجنة التوظيف في مجلس الإدارة هو التوظيف لأي منصب قد يحتاجه المركز. تتكون اللجنة من رئيس المجلس وعضو آخر من المجلس، المدير العام، والمسؤول عن الوحدة أو البرنامج الذي سيُعين فيه الموظف الجديد. في بعض الحالات، يمكن لمركز معاً طلب متخصص أو خبير خارجي للمشاركة في المقابلات وعمليات التوظيف.
تتكون اللجنة من رئيس المجلس، أمين الصندوق، وعضو آخر من مجلس الإدارة، بالإضافة إلى المدير العام ومسؤول المالية. يعمل أمين الصندوق كرئيس للجنة؛ وفي حال غيابه، يتولى رئيس المجلس دور الرئيس. اللجنة المالية لمجلس الإدارة مسؤولة عن جميع القضايا المالية وتساعد المجلس في إشرافه على: